Der Wasserstand der Elbe brachte im Laufe der Jahrzehnte das Aus für den direkten Umschlag der Waren an den Elbufern. In den letzten hundert Jahren verlor der Fluss pro Jahr einen Zentimeter an Fahrtiefe. Reichten die einstigen Anlegestellen der Frachtkähne vom heutigen Mückenwirt bis zum Petriförder, können jetzt keine Schiffe mehr direkt von der Elbe aus ihre Ladung aufnehmen.

Aus der Reformationszeit und den nachreformatorischen Jahren gibt es zu wenige Aufzeichnungen über Schifffahrt und Hafen, als dass man sich ein Bild der damaligen Schiffsbe- und entladungen machen könnte. Sicher spielte die ausgezeichnete Lage der Stadt für den wasserseitigen Umschlag eine wichtige Rolle.